1989年(平成元年)11月4日の大学同窓会理事会において、酪農学園大学同窓会(1960年発足)を改組し、大学同窓会校友会と名称を変更した。
2011年(平成23)の大学再編により従来の上記3学部8学科体制から2学群5学類に移行した。この学部学科廃止に伴い、校友会もそれまでの学科同窓会を統合して一本化する方針を2011年度代議員総会において決定し、大学卒業生および大学院修了者個々人が正会員として校友会を構成することとした。その後、2012年~2014年にかけて会則や会費等を変更して今日に至っている。